Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Z2

Fndc5, Fibronectin type III domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc5Q8K4Z2 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms