Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hecw1Q8K4P8 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Hecw1Q8K4P8 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Hecw1Q8K4P8 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Hecw1Q8K4P8 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Hecw1Q8K4P8 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Hecw1Q8K4P8 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Hecw1Q8K4P8 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hecw1Q8K4P8 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hecw1Q8K4P8 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hecw1Q8K4P8 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hecw1Q8K4P8 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Hecw1Q8K4P8 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hecw1Q8K4P8 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Hecw1Q8K4P8 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Hecw1Q8K4P8 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Hecw1Q8K4P8 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Hecw1Q8K4P8 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Hecw1Q8K4P8 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Hecw1Q8K4P8 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Hecw1Q8K4P8 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Hecw1Q8K4P8 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Hecw1Q8K4P8 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Hecw1Q8K4P8 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Hecw1Q8K4P8 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Hecw1Q8K4P8 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Hecw1Q8K4P8 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hecw1Q8K4P8 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hecw1Q8K4P8 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hecw1Q8K4P8 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hecw1Q8K4P8 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hecw1Q8K4P8 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hecw1Q8K4P8 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hecw1Q8K4P8 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hecw1Q8K4P8 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hecw1Q8K4P8 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hecw1Q8K4P8 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Hecw1Q8K4P8 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hecw1Q8K4P8 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hecw1Q8K4P8 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hecw1Q8K4P8 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hecw1Q8K4P8 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hecw1Q8K4P8 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hecw1Q8K4P8 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hecw1Q8K4P8 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hecw1Q8K4P8 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Hecw1Q8K4P8 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Hecw1Q8K4P8 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hecw1Q8K4P8 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hecw1Q8K4P8 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hecw1Q8K4P8 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hecw1Q8K4P8 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hecw1Q8K4P8 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hecw1Q8K4P8 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hecw1Q8K4P8 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hecw1Q8K4P8 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Hecw1Q8K4P8 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Hecw1Q8K4P8 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Hecw1Q8K4P8 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Hecw1Q8K4P8 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Hecw1Q8K4P8 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hecw1Q8K4P8 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hecw1Q8K4P8 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hecw1Q8K4P8 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Hecw1Q8K4P8 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Hecw1Q8K4P8 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hecw1Q8K4P8 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Hecw1Q8K4P8 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Hecw1Q8K4P8 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hecw1Q8K4P8 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hecw1Q8K4P8 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hecw1Q8K4P8 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hecw1Q8K4P8 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hecw1Q8K4P8 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hecw1Q8K4P8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hecw1Q8K4P8 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hecw1Q8K4P8 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hecw1Q8K4P8 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hecw1Q8K4P8 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hecw1Q8K4P8 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Hecw1Q8K4P8 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hecw1Q8K4P8 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hecw1Q8K4P8 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hecw1Q8K4P8 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hecw1Q8K4P8 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hecw1Q8K4P8 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hecw1Q8K4P8 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hecw1Q8K4P8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hecw1Q8K4P8 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hecw1Q8K4P8 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hecw1Q8K4P8 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hecw1Q8K4P8 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hecw1Q8K4P8 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Hecw1Q8K4P8 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hecw1Q8K4P8 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Hecw1Q8K4P8 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hecw1Q8K4P8 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hecw1Q8K4P8 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hecw1Q8K4P8 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hecw1Q8K4P8 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms