Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3Y3

Lin28a, Protein lin-28 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28aQ8K3Y3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lin28aQ8K3Y3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lin28aQ8K3Y3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lin28aQ8K3Y3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lin28aQ8K3Y3 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lin28aQ8K3Y3 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lin28aQ8K3Y3 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lin28aQ8K3Y3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lin28aQ8K3Y3 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lin28aQ8K3Y3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lin28aQ8K3Y3 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lin28aQ8K3Y3 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lin28aQ8K3Y3 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lin28aQ8K3Y3 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lin28aQ8K3Y3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lin28aQ8K3Y3 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lin28aQ8K3Y3 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lin28aQ8K3Y3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lin28aQ8K3Y3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lin28aQ8K3Y3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lin28aQ8K3Y3 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lin28aQ8K3Y3 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lin28aQ8K3Y3 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lin28aQ8K3Y3 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lin28aQ8K3Y3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lin28aQ8K3Y3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lin28aQ8K3Y3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lin28aQ8K3Y3 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lin28aQ8K3Y3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lin28aQ8K3Y3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lin28aQ8K3Y3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lin28aQ8K3Y3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lin28aQ8K3Y3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lin28aQ8K3Y3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lin28aQ8K3Y3 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lin28aQ8K3Y3 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lin28aQ8K3Y3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lin28aQ8K3Y3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lin28aQ8K3Y3 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lin28aQ8K3Y3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lin28aQ8K3Y3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lin28aQ8K3Y3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lin28aQ8K3Y3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lin28aQ8K3Y3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lin28aQ8K3Y3 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lin28aQ8K3Y3 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lin28aQ8K3Y3 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lin28aQ8K3Y3 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lin28aQ8K3Y3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lin28aQ8K3Y3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lin28aQ8K3Y3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lin28aQ8K3Y3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lin28aQ8K3Y3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lin28aQ8K3Y3 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lin28aQ8K3Y3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lin28aQ8K3Y3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lin28aQ8K3Y3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lin28aQ8K3Y3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lin28aQ8K3Y3 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lin28aQ8K3Y3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lin28aQ8K3Y3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lin28aQ8K3Y3 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lin28aQ8K3Y3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lin28aQ8K3Y3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lin28aQ8K3Y3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lin28aQ8K3Y3 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lin28aQ8K3Y3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lin28aQ8K3Y3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lin28aQ8K3Y3 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lin28aQ8K3Y3 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lin28aQ8K3Y3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lin28aQ8K3Y3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lin28aQ8K3Y3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lin28aQ8K3Y3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lin28aQ8K3Y3 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lin28aQ8K3Y3 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lin28aQ8K3Y3 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lin28aQ8K3Y3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lin28aQ8K3Y3 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lin28aQ8K3Y3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lin28aQ8K3Y3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lin28aQ8K3Y3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lin28aQ8K3Y3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lin28aQ8K3Y3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lin28aQ8K3Y3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lin28aQ8K3Y3 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms