Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
MyripQ8K3I4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MyripQ8K3I4 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MyripQ8K3I4 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MyripQ8K3I4 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MyripQ8K3I4 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MyripQ8K3I4 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
MyripQ8K3I4 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MyripQ8K3I4 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MyripQ8K3I4 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MyripQ8K3I4 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MyripQ8K3I4 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MyripQ8K3I4 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MyripQ8K3I4 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MyripQ8K3I4 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MyripQ8K3I4 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MyripQ8K3I4 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MyripQ8K3I4 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MyripQ8K3I4 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MyripQ8K3I4 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MyripQ8K3I4 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MyripQ8K3I4 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MyripQ8K3I4 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MyripQ8K3I4 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MyripQ8K3I4 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MyripQ8K3I4 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MyripQ8K3I4 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MyripQ8K3I4 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MyripQ8K3I4 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MyripQ8K3I4 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MyripQ8K3I4 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MyripQ8K3I4 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MyripQ8K3I4 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MyripQ8K3I4 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MyripQ8K3I4 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MyripQ8K3I4 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MyripQ8K3I4 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
MyripQ8K3I4 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MyripQ8K3I4 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MyripQ8K3I4 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MyripQ8K3I4 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MyripQ8K3I4 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MyripQ8K3I4 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MyripQ8K3I4 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MyripQ8K3I4 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MyripQ8K3I4 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MyripQ8K3I4 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MyripQ8K3I4 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MyripQ8K3I4 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MyripQ8K3I4 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MyripQ8K3I4 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MyripQ8K3I4 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MyripQ8K3I4 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MyripQ8K3I4 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
MyripQ8K3I4 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MyripQ8K3I4 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MyripQ8K3I4 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
MyripQ8K3I4 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
MyripQ8K3I4 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MyripQ8K3I4 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MyripQ8K3I4 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MyripQ8K3I4 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MyripQ8K3I4 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MyripQ8K3I4 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MyripQ8K3I4 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MyripQ8K3I4 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MyripQ8K3I4 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MyripQ8K3I4 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MyripQ8K3I4 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MyripQ8K3I4 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MyripQ8K3I4 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MyripQ8K3I4 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MyripQ8K3I4 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MyripQ8K3I4 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MyripQ8K3I4 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MyripQ8K3I4 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MyripQ8K3I4 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MyripQ8K3I4 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MyripQ8K3I4 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MyripQ8K3I4 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MyripQ8K3I4 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MyripQ8K3I4 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MyripQ8K3I4 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MyripQ8K3I4 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MyripQ8K3I4 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MyripQ8K3I4 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
MyripQ8K3I4 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MyripQ8K3I4 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MyripQ8K3I4 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MyripQ8K3I4 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MyripQ8K3I4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MyripQ8K3I4 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MyripQ8K3I4 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MyripQ8K3I4 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MyripQ8K3I4 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MyripQ8K3I4 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MyripQ8K3I4 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
MyripQ8K3I4 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MyripQ8K3I4 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MyripQ8K3I4 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms