Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf39Q8K2Z2 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79 ms