Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brd3Q8K2F0 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms