Protein–RNA interactions for Protein: Q8K299

Scara5, Scavenger receptor class A member 5, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scara5Q8K299 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scara5Q8K299 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scara5Q8K299 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scara5Q8K299 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scara5Q8K299 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scara5Q8K299 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Scara5Q8K299 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scara5Q8K299 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Scara5Q8K299 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scara5Q8K299 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Scara5Q8K299 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scara5Q8K299 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scara5Q8K299 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scara5Q8K299 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scara5Q8K299 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Scara5Q8K299 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scara5Q8K299 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scara5Q8K299 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scara5Q8K299 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scara5Q8K299 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scara5Q8K299 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scara5Q8K299 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Scara5Q8K299 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scara5Q8K299 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scara5Q8K299 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scara5Q8K299 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scara5Q8K299 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scara5Q8K299 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scara5Q8K299 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scara5Q8K299 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scara5Q8K299 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Scara5Q8K299 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scara5Q8K299 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scara5Q8K299 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scara5Q8K299 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scara5Q8K299 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scara5Q8K299 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scara5Q8K299 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scara5Q8K299 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scara5Q8K299 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scara5Q8K299 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scara5Q8K299 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scara5Q8K299 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scara5Q8K299 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scara5Q8K299 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scara5Q8K299 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scara5Q8K299 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scara5Q8K299 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scara5Q8K299 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scara5Q8K299 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scara5Q8K299 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scara5Q8K299 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scara5Q8K299 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scara5Q8K299 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scara5Q8K299 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scara5Q8K299 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scara5Q8K299 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scara5Q8K299 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scara5Q8K299 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scara5Q8K299 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scara5Q8K299 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scara5Q8K299 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scara5Q8K299 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scara5Q8K299 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scara5Q8K299 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Scara5Q8K299 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scara5Q8K299 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scara5Q8K299 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scara5Q8K299 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scara5Q8K299 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scara5Q8K299 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scara5Q8K299 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scara5Q8K299 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scara5Q8K299 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Scara5Q8K299 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scara5Q8K299 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scara5Q8K299 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Scara5Q8K299 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scara5Q8K299 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scara5Q8K299 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scara5Q8K299 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scara5Q8K299 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scara5Q8K299 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scara5Q8K299 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scara5Q8K299 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scara5Q8K299 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scara5Q8K299 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scara5Q8K299 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scara5Q8K299 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scara5Q8K299 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Scara5Q8K299 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scara5Q8K299 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms