Protein–RNA interactions for Protein: Q8K202

Polr1e, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1eQ8K202 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Polr1eQ8K202 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Polr1eQ8K202 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Polr1eQ8K202 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Polr1eQ8K202 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Polr1eQ8K202 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Polr1eQ8K202 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Polr1eQ8K202 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Polr1eQ8K202 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Polr1eQ8K202 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Polr1eQ8K202 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Polr1eQ8K202 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Polr1eQ8K202 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Polr1eQ8K202 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Polr1eQ8K202 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Polr1eQ8K202 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Polr1eQ8K202 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Polr1eQ8K202 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Polr1eQ8K202 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Polr1eQ8K202 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Polr1eQ8K202 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Polr1eQ8K202 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Polr1eQ8K202 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Polr1eQ8K202 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Polr1eQ8K202 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Polr1eQ8K202 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Polr1eQ8K202 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Polr1eQ8K202 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Polr1eQ8K202 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Polr1eQ8K202 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Polr1eQ8K202 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Polr1eQ8K202 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Polr1eQ8K202 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Polr1eQ8K202 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Polr1eQ8K202 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Polr1eQ8K202 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Polr1eQ8K202 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Polr1eQ8K202 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Polr1eQ8K202 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Polr1eQ8K202 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Polr1eQ8K202 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Polr1eQ8K202 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Polr1eQ8K202 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr1eQ8K202 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms