Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1Y2

Prkd3, Serine/threonine-protein kinase D3, mousemouse

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd3Q8K1Y2 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prkd3Q8K1Y2 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms