Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1E6

Alkbh3, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh3Q8K1E6 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms