Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkn3Q8K045 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkn3Q8K045 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkn3Q8K045 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkn3Q8K045 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkn3Q8K045 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkn3Q8K045 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkn3Q8K045 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkn3Q8K045 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkn3Q8K045 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkn3Q8K045 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkn3Q8K045 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
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Pkn3Q8K045 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkn3Q8K045 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkn3Q8K045 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkn3Q8K045 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkn3Q8K045 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Pkn3Q8K045 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Pkn3Q8K045 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkn3Q8K045 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkn3Q8K045 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkn3Q8K045 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pkn3Q8K045 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pkn3Q8K045 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pkn3Q8K045 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkn3Q8K045 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkn3Q8K045 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkn3Q8K045 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkn3Q8K045 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkn3Q8K045 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkn3Q8K045 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkn3Q8K045 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkn3Q8K045 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkn3Q8K045 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkn3Q8K045 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkn3Q8K045 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkn3Q8K045 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Pkn3Q8K045 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkn3Q8K045 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkn3Q8K045 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkn3Q8K045 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkn3Q8K045 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkn3Q8K045 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkn3Q8K045 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Pkn3Q8K045 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Pkn3Q8K045 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkn3Q8K045 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkn3Q8K045 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Pkn3Q8K045 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Pkn3Q8K045 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkn3Q8K045 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkn3Q8K045 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkn3Q8K045 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkn3Q8K045 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkn3Q8K045 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkn3Q8K045 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Pkn3Q8K045 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkn3Q8K045 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkn3Q8K045 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkn3Q8K045 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkn3Q8K045 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkn3Q8K045 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkn3Q8K045 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkn3Q8K045 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkn3Q8K045 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkn3Q8K045 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkn3Q8K045 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkn3Q8K045 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkn3Q8K045 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkn3Q8K045 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkn3Q8K045 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkn3Q8K045 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkn3Q8K045 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkn3Q8K045 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkn3Q8K045 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkn3Q8K045 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms