Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE6

Copa, Coatomer subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopaQ8CIE6 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms