Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHS8

Vps37a, Vacuolar protein sorting-associated protein 37A, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps37aQ8CHS8 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps37aQ8CHS8 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps37aQ8CHS8 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps37aQ8CHS8 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps37aQ8CHS8 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps37aQ8CHS8 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps37aQ8CHS8 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps37aQ8CHS8 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps37aQ8CHS8 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps37aQ8CHS8 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps37aQ8CHS8 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps37aQ8CHS8 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps37aQ8CHS8 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps37aQ8CHS8 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps37aQ8CHS8 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps37aQ8CHS8 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps37aQ8CHS8 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps37aQ8CHS8 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps37aQ8CHS8 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps37aQ8CHS8 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps37aQ8CHS8 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps37aQ8CHS8 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps37aQ8CHS8 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps37aQ8CHS8 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps37aQ8CHS8 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps37aQ8CHS8 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps37aQ8CHS8 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps37aQ8CHS8 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps37aQ8CHS8 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps37aQ8CHS8 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps37aQ8CHS8 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps37aQ8CHS8 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps37aQ8CHS8 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps37aQ8CHS8 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps37aQ8CHS8 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps37aQ8CHS8 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps37aQ8CHS8 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps37aQ8CHS8 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps37aQ8CHS8 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps37aQ8CHS8 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps37aQ8CHS8 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps37aQ8CHS8 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps37aQ8CHS8 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps37aQ8CHS8 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps37aQ8CHS8 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps37aQ8CHS8 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps37aQ8CHS8 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps37aQ8CHS8 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps37aQ8CHS8 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps37aQ8CHS8 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps37aQ8CHS8 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps37aQ8CHS8 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps37aQ8CHS8 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps37aQ8CHS8 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps37aQ8CHS8 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps37aQ8CHS8 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps37aQ8CHS8 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps37aQ8CHS8 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps37aQ8CHS8 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vps37aQ8CHS8 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vps37aQ8CHS8 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vps37aQ8CHS8 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps37aQ8CHS8 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps37aQ8CHS8 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps37aQ8CHS8 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps37aQ8CHS8 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps37aQ8CHS8 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps37aQ8CHS8 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps37aQ8CHS8 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps37aQ8CHS8 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps37aQ8CHS8 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps37aQ8CHS8 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps37aQ8CHS8 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps37aQ8CHS8 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps37aQ8CHS8 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps37aQ8CHS8 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps37aQ8CHS8 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps37aQ8CHS8 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps37aQ8CHS8 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps37aQ8CHS8 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps37aQ8CHS8 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps37aQ8CHS8 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps37aQ8CHS8 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps37aQ8CHS8 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps37aQ8CHS8 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps37aQ8CHS8 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps37aQ8CHS8 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps37aQ8CHS8 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps37aQ8CHS8 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps37aQ8CHS8 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps37aQ8CHS8 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps37aQ8CHS8 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps37aQ8CHS8 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps37aQ8CHS8 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps37aQ8CHS8 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps37aQ8CHS8 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps37aQ8CHS8 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps37aQ8CHS8 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps37aQ8CHS8 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps37aQ8CHS8 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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