Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms