Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGA3

Slc43a2, Large neutral amino acids transporter small subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc43a2Q8CGA3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc43a2Q8CGA3 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc43a2Q8CGA3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc43a2Q8CGA3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc43a2Q8CGA3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc43a2Q8CGA3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc43a2Q8CGA3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc43a2Q8CGA3 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc43a2Q8CGA3 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc43a2Q8CGA3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc43a2Q8CGA3 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc43a2Q8CGA3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc43a2Q8CGA3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc43a2Q8CGA3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms