Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms