Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc38Q8CDN8 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms