Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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