Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB62

Cntrob, Centrobin, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntrobQ8CB62 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CntrobQ8CB62 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CntrobQ8CB62 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CntrobQ8CB62 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CntrobQ8CB62 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CntrobQ8CB62 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CntrobQ8CB62 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CntrobQ8CB62 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CntrobQ8CB62 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CntrobQ8CB62 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CntrobQ8CB62 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CntrobQ8CB62 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CntrobQ8CB62 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CntrobQ8CB62 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CntrobQ8CB62 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CntrobQ8CB62 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CntrobQ8CB62 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CntrobQ8CB62 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CntrobQ8CB62 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CntrobQ8CB62 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CntrobQ8CB62 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CntrobQ8CB62 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CntrobQ8CB62 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CntrobQ8CB62 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CntrobQ8CB62 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CntrobQ8CB62 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CntrobQ8CB62 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CntrobQ8CB62 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CntrobQ8CB62 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CntrobQ8CB62 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CntrobQ8CB62 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CntrobQ8CB62 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CntrobQ8CB62 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CntrobQ8CB62 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CntrobQ8CB62 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CntrobQ8CB62 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CntrobQ8CB62 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CntrobQ8CB62 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CntrobQ8CB62 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CntrobQ8CB62 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CntrobQ8CB62 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CntrobQ8CB62 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CntrobQ8CB62 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CntrobQ8CB62 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms