Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8U0

Ppfibp1, Liprin-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp1Q8C8U0 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ppfibp1Q8C8U0 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ppfibp1Q8C8U0 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ppfibp1Q8C8U0 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ppfibp1Q8C8U0 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ppfibp1Q8C8U0 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ppfibp1Q8C8U0 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ppfibp1Q8C8U0 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ppfibp1Q8C8U0 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ppfibp1Q8C8U0 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ppfibp1Q8C8U0 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ppfibp1Q8C8U0 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ppfibp1Q8C8U0 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ppfibp1Q8C8U0 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ppfibp1Q8C8U0 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ppfibp1Q8C8U0 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ppfibp1Q8C8U0 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ppfibp1Q8C8U0 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ppfibp1Q8C8U0 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ppfibp1Q8C8U0 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ppfibp1Q8C8U0 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ppfibp1Q8C8U0 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ppfibp1Q8C8U0 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ppfibp1Q8C8U0 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ppfibp1Q8C8U0 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ppfibp1Q8C8U0 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ppfibp1Q8C8U0 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ppfibp1Q8C8U0 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ppfibp1Q8C8U0 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ppfibp1Q8C8U0 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ppfibp1Q8C8U0 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ppfibp1Q8C8U0 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ppfibp1Q8C8U0 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ppfibp1Q8C8U0 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ppfibp1Q8C8U0 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ppfibp1Q8C8U0 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ppfibp1Q8C8U0 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ppfibp1Q8C8U0 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ppfibp1Q8C8U0 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ppfibp1Q8C8U0 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ppfibp1Q8C8U0 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ppfibp1Q8C8U0 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ppfibp1Q8C8U0 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ppfibp1Q8C8U0 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ppfibp1Q8C8U0 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ppfibp1Q8C8U0 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ppfibp1Q8C8U0 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ppfibp1Q8C8U0 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ppfibp1Q8C8U0 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ppfibp1Q8C8U0 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ppfibp1Q8C8U0 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ppfibp1Q8C8U0 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ppfibp1Q8C8U0 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ppfibp1Q8C8U0 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ppfibp1Q8C8U0 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ppfibp1Q8C8U0 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ppfibp1Q8C8U0 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ppfibp1Q8C8U0 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppfibp1Q8C8U0 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppfibp1Q8C8U0 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppfibp1Q8C8U0 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppfibp1Q8C8U0 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppfibp1Q8C8U0 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppfibp1Q8C8U0 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppfibp1Q8C8U0 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppfibp1Q8C8U0 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppfibp1Q8C8U0 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppfibp1Q8C8U0 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppfibp1Q8C8U0 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppfibp1Q8C8U0 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppfibp1Q8C8U0 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppfibp1Q8C8U0 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppfibp1Q8C8U0 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppfibp1Q8C8U0 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppfibp1Q8C8U0 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppfibp1Q8C8U0 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppfibp1Q8C8U0 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppfibp1Q8C8U0 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppfibp1Q8C8U0 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppfibp1Q8C8U0 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppfibp1Q8C8U0 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppfibp1Q8C8U0 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppfibp1Q8C8U0 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppfibp1Q8C8U0 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ppfibp1Q8C8U0 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ppfibp1Q8C8U0 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ppfibp1Q8C8U0 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ppfibp1Q8C8U0 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ppfibp1Q8C8U0 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ppfibp1Q8C8U0 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ppfibp1Q8C8U0 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ppfibp1Q8C8U0 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ppfibp1Q8C8U0 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ppfibp1Q8C8U0 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ppfibp1Q8C8U0 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ppfibp1Q8C8U0 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ppfibp1Q8C8U0 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms