Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7E7

Stbd1, Starch-binding domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stbd1Q8C7E7 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
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Stbd1Q8C7E7 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stbd1Q8C7E7 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stbd1Q8C7E7 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stbd1Q8C7E7 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stbd1Q8C7E7 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stbd1Q8C7E7 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Stbd1Q8C7E7 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stbd1Q8C7E7 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stbd1Q8C7E7 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Stbd1Q8C7E7 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Stbd1Q8C7E7 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stbd1Q8C7E7 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stbd1Q8C7E7 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stbd1Q8C7E7 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Stbd1Q8C7E7 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Stbd1Q8C7E7 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stbd1Q8C7E7 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stbd1Q8C7E7 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stbd1Q8C7E7 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Stbd1Q8C7E7 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Stbd1Q8C7E7 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stbd1Q8C7E7 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Stbd1Q8C7E7 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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Stbd1Q8C7E7 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stbd1Q8C7E7 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stbd1Q8C7E7 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Stbd1Q8C7E7 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Stbd1Q8C7E7 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Stbd1Q8C7E7 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stbd1Q8C7E7 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stbd1Q8C7E7 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stbd1Q8C7E7 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stbd1Q8C7E7 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stbd1Q8C7E7 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stbd1Q8C7E7 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stbd1Q8C7E7 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stbd1Q8C7E7 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stbd1Q8C7E7 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Stbd1Q8C7E7 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stbd1Q8C7E7 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Stbd1Q8C7E7 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms