Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5N3

Cwc22, Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc22Q8C5N3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cwc22Q8C5N3 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cwc22Q8C5N3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cwc22Q8C5N3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cwc22Q8C5N3 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cwc22Q8C5N3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cwc22Q8C5N3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cwc22Q8C5N3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Cwc22Q8C5N3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cwc22Q8C5N3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cwc22Q8C5N3 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cwc22Q8C5N3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cwc22Q8C5N3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cwc22Q8C5N3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cwc22Q8C5N3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cwc22Q8C5N3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cwc22Q8C5N3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cwc22Q8C5N3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cwc22Q8C5N3 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cwc22Q8C5N3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cwc22Q8C5N3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cwc22Q8C5N3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cwc22Q8C5N3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cwc22Q8C5N3 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cwc22Q8C5N3 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Cwc22Q8C5N3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cwc22Q8C5N3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cwc22Q8C5N3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cwc22Q8C5N3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cwc22Q8C5N3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cwc22Q8C5N3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cwc22Q8C5N3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cwc22Q8C5N3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cwc22Q8C5N3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cwc22Q8C5N3 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cwc22Q8C5N3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cwc22Q8C5N3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cwc22Q8C5N3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cwc22Q8C5N3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cwc22Q8C5N3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cwc22Q8C5N3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cwc22Q8C5N3 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cwc22Q8C5N3 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Cwc22Q8C5N3 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cwc22Q8C5N3 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cwc22Q8C5N3 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cwc22Q8C5N3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cwc22Q8C5N3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cwc22Q8C5N3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cwc22Q8C5N3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cwc22Q8C5N3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cwc22Q8C5N3 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cwc22Q8C5N3 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cwc22Q8C5N3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cwc22Q8C5N3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cwc22Q8C5N3 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cwc22Q8C5N3 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Cwc22Q8C5N3 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cwc22Q8C5N3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cwc22Q8C5N3 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cwc22Q8C5N3 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cwc22Q8C5N3 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cwc22Q8C5N3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cwc22Q8C5N3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cwc22Q8C5N3 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cwc22Q8C5N3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cwc22Q8C5N3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cwc22Q8C5N3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cwc22Q8C5N3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cwc22Q8C5N3 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Cwc22Q8C5N3 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Cwc22Q8C5N3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cwc22Q8C5N3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cwc22Q8C5N3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cwc22Q8C5N3 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cwc22Q8C5N3 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cwc22Q8C5N3 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Cwc22Q8C5N3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cwc22Q8C5N3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cwc22Q8C5N3 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cwc22Q8C5N3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cwc22Q8C5N3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cwc22Q8C5N3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cwc22Q8C5N3 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cwc22Q8C5N3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cwc22Q8C5N3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cwc22Q8C5N3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cwc22Q8C5N3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cwc22Q8C5N3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cwc22Q8C5N3 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cwc22Q8C5N3 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cwc22Q8C5N3 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cwc22Q8C5N3 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cwc22Q8C5N3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cwc22Q8C5N3 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cwc22Q8C5N3 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cwc22Q8C5N3 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cwc22Q8C5N3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cwc22Q8C5N3 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cwc22Q8C5N3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms