Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdac7Q8C2B3 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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