Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

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Length 508 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FarsaQ8C0C7 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FarsaQ8C0C7 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FarsaQ8C0C7 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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FarsaQ8C0C7 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FarsaQ8C0C7 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FarsaQ8C0C7 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FarsaQ8C0C7 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FarsaQ8C0C7 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FarsaQ8C0C7 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FarsaQ8C0C7 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FarsaQ8C0C7 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FarsaQ8C0C7 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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FarsaQ8C0C7 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FarsaQ8C0C7 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FarsaQ8C0C7 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FarsaQ8C0C7 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FarsaQ8C0C7 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FarsaQ8C0C7 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FarsaQ8C0C7 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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FarsaQ8C0C7 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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FarsaQ8C0C7 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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FarsaQ8C0C7 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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FarsaQ8C0C7 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FarsaQ8C0C7 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FarsaQ8C0C7 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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FarsaQ8C0C7 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FarsaQ8C0C7 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FarsaQ8C0C7 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FarsaQ8C0C7 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FarsaQ8C0C7 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FarsaQ8C0C7 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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FarsaQ8C0C7 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FarsaQ8C0C7 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
FarsaQ8C0C7 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FarsaQ8C0C7 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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