Protein–RNA interactions for Protein: Q8C080

Snx16, Sorting nexin-16, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx16Q8C080 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx16Q8C080 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx16Q8C080 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx16Q8C080 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx16Q8C080 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx16Q8C080 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx16Q8C080 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx16Q8C080 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx16Q8C080 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx16Q8C080 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx16Q8C080 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx16Q8C080 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx16Q8C080 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx16Q8C080 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx16Q8C080 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx16Q8C080 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx16Q8C080 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx16Q8C080 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx16Q8C080 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx16Q8C080 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx16Q8C080 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx16Q8C080 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx16Q8C080 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx16Q8C080 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx16Q8C080 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx16Q8C080 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx16Q8C080 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx16Q8C080 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx16Q8C080 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx16Q8C080 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx16Q8C080 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx16Q8C080 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx16Q8C080 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx16Q8C080 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx16Q8C080 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx16Q8C080 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx16Q8C080 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx16Q8C080 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx16Q8C080 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx16Q8C080 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx16Q8C080 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx16Q8C080 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx16Q8C080 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx16Q8C080 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx16Q8C080 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx16Q8C080 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx16Q8C080 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx16Q8C080 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx16Q8C080 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx16Q8C080 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx16Q8C080 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx16Q8C080 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx16Q8C080 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx16Q8C080 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx16Q8C080 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx16Q8C080 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx16Q8C080 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx16Q8C080 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx16Q8C080 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx16Q8C080 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx16Q8C080 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx16Q8C080 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx16Q8C080 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx16Q8C080 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx16Q8C080 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx16Q8C080 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx16Q8C080 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx16Q8C080 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx16Q8C080 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx16Q8C080 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx16Q8C080 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx16Q8C080 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx16Q8C080 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx16Q8C080 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx16Q8C080 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx16Q8C080 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx16Q8C080 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx16Q8C080 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx16Q8C080 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx16Q8C080 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx16Q8C080 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx16Q8C080 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx16Q8C080 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Snx16Q8C080 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Snx16Q8C080 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx16Q8C080 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx16Q8C080 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx16Q8C080 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx16Q8C080 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx16Q8C080 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx16Q8C080 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx16Q8C080 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx16Q8C080 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx16Q8C080 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx16Q8C080 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx16Q8C080 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx16Q8C080 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx16Q8C080 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx16Q8C080 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx16Q8C080 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms