Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXT9

Sec22c, Vesicle-trafficking protein SEC22c, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22cQ8BXT9 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sec22cQ8BXT9 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms