Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX22

Sall4, Sal-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,067 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall4Q8BX22 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sall4Q8BX22 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sall4Q8BX22 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sall4Q8BX22 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Sall4Q8BX22 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sall4Q8BX22 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sall4Q8BX22 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sall4Q8BX22 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sall4Q8BX22 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sall4Q8BX22 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sall4Q8BX22 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sall4Q8BX22 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sall4Q8BX22 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sall4Q8BX22 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sall4Q8BX22 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sall4Q8BX22 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Sall4Q8BX22 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sall4Q8BX22 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sall4Q8BX22 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Sall4Q8BX22 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Sall4Q8BX22 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Sall4Q8BX22 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sall4Q8BX22 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sall4Q8BX22 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sall4Q8BX22 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sall4Q8BX22 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sall4Q8BX22 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sall4Q8BX22 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sall4Q8BX22 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Sall4Q8BX22 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sall4Q8BX22 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms