Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ube3dQ8BX13 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube3dQ8BX13 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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