Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp38Q8BW70 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp38Q8BW70 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
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Usp38Q8BW70 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp38Q8BW70 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp38Q8BW70 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp38Q8BW70 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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Usp38Q8BW70 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp38Q8BW70 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp38Q8BW70 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp38Q8BW70 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp38Q8BW70 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp38Q8BW70 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp38Q8BW70 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp38Q8BW70 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp38Q8BW70 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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Usp38Q8BW70 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp38Q8BW70 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
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Usp38Q8BW70 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp38Q8BW70 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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Usp38Q8BW70 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp38Q8BW70 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp38Q8BW70 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
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Usp38Q8BW70 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp38Q8BW70 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
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Usp38Q8BW70 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
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Usp38Q8BW70 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp38Q8BW70 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp38Q8BW70 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp38Q8BW70 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp38Q8BW70 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp38Q8BW70 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
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Usp38Q8BW70 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp38Q8BW70 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp38Q8BW70 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp38Q8BW70 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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Usp38Q8BW70 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
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Usp38Q8BW70 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp38Q8BW70 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp38Q8BW70 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp38Q8BW70 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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Usp38Q8BW70 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp38Q8BW70 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp38Q8BW70 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp38Q8BW70 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp38Q8BW70 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp38Q8BW70 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp38Q8BW70 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp38Q8BW70 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp38Q8BW70 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp38Q8BW70 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp38Q8BW70 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp38Q8BW70 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp38Q8BW70 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp38Q8BW70 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp38Q8BW70 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp38Q8BW70 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp38Q8BW70 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp38Q8BW70 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp38Q8BW70 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp38Q8BW70 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp38Q8BW70 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms