Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
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Pggt1bQ8BUY9 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pggt1bQ8BUY9 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Pggt1bQ8BUY9 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Pggt1bQ8BUY9 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Pggt1bQ8BUY9 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pggt1bQ8BUY9 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms