Protein–RNA interactions for Protein: Q8BR65

Suds3, Sin3 histone deacetylase corepressor complex component SDS3, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Suds3Q8BR65 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Suds3Q8BR65 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Suds3Q8BR65 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Suds3Q8BR65 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Suds3Q8BR65 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Suds3Q8BR65 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Suds3Q8BR65 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Suds3Q8BR65 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Suds3Q8BR65 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Suds3Q8BR65 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Suds3Q8BR65 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Suds3Q8BR65 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Suds3Q8BR65 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Suds3Q8BR65 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Suds3Q8BR65 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Suds3Q8BR65 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Suds3Q8BR65 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Suds3Q8BR65 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Suds3Q8BR65 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Suds3Q8BR65 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Suds3Q8BR65 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Suds3Q8BR65 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Suds3Q8BR65 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Suds3Q8BR65 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Suds3Q8BR65 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Suds3Q8BR65 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Suds3Q8BR65 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Suds3Q8BR65 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Suds3Q8BR65 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Suds3Q8BR65 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Suds3Q8BR65 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Suds3Q8BR65 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Suds3Q8BR65 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Suds3Q8BR65 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Suds3Q8BR65 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Suds3Q8BR65 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Suds3Q8BR65 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Suds3Q8BR65 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Suds3Q8BR65 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Suds3Q8BR65 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Suds3Q8BR65 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Suds3Q8BR65 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Suds3Q8BR65 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Suds3Q8BR65 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Suds3Q8BR65 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Suds3Q8BR65 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Suds3Q8BR65 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Suds3Q8BR65 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Suds3Q8BR65 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Suds3Q8BR65 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Suds3Q8BR65 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Suds3Q8BR65 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Suds3Q8BR65 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Suds3Q8BR65 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Suds3Q8BR65 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Suds3Q8BR65 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Suds3Q8BR65 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Suds3Q8BR65 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Suds3Q8BR65 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Suds3Q8BR65 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Suds3Q8BR65 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Suds3Q8BR65 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Suds3Q8BR65 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Suds3Q8BR65 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Suds3Q8BR65 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Suds3Q8BR65 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Suds3Q8BR65 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Suds3Q8BR65 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Suds3Q8BR65 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Suds3Q8BR65 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Suds3Q8BR65 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Suds3Q8BR65 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Suds3Q8BR65 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Suds3Q8BR65 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Suds3Q8BR65 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Suds3Q8BR65 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Suds3Q8BR65 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Suds3Q8BR65 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Suds3Q8BR65 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Suds3Q8BR65 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Suds3Q8BR65 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Suds3Q8BR65 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Suds3Q8BR65 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Suds3Q8BR65 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Suds3Q8BR65 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Suds3Q8BR65 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Suds3Q8BR65 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Suds3Q8BR65 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Suds3Q8BR65 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Suds3Q8BR65 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Suds3Q8BR65 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Suds3Q8BR65 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Suds3Q8BR65 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Suds3Q8BR65 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Suds3Q8BR65 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Suds3Q8BR65 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Suds3Q8BR65 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Suds3Q8BR65 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Suds3Q8BR65 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Suds3Q8BR65 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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