Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQU3

Sdhaf3, Succinate dehydrogenase assembly factor 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdhaf3Q8BQU3 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sdhaf3Q8BQU3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sdhaf3Q8BQU3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sdhaf3Q8BQU3 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sdhaf3Q8BQU3 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sdhaf3Q8BQU3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sdhaf3Q8BQU3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sdhaf3Q8BQU3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sdhaf3Q8BQU3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sdhaf3Q8BQU3 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sdhaf3Q8BQU3 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sdhaf3Q8BQU3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sdhaf3Q8BQU3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdhaf3Q8BQU3 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdhaf3Q8BQU3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdhaf3Q8BQU3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdhaf3Q8BQU3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdhaf3Q8BQU3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdhaf3Q8BQU3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdhaf3Q8BQU3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdhaf3Q8BQU3 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdhaf3Q8BQU3 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdhaf3Q8BQU3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdhaf3Q8BQU3 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdhaf3Q8BQU3 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdhaf3Q8BQU3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdhaf3Q8BQU3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdhaf3Q8BQU3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdhaf3Q8BQU3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdhaf3Q8BQU3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdhaf3Q8BQU3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdhaf3Q8BQU3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdhaf3Q8BQU3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdhaf3Q8BQU3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdhaf3Q8BQU3 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdhaf3Q8BQU3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdhaf3Q8BQU3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdhaf3Q8BQU3 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdhaf3Q8BQU3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdhaf3Q8BQU3 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdhaf3Q8BQU3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdhaf3Q8BQU3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdhaf3Q8BQU3 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdhaf3Q8BQU3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdhaf3Q8BQU3 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdhaf3Q8BQU3 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdhaf3Q8BQU3 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdhaf3Q8BQU3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdhaf3Q8BQU3 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdhaf3Q8BQU3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdhaf3Q8BQU3 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdhaf3Q8BQU3 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdhaf3Q8BQU3 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdhaf3Q8BQU3 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdhaf3Q8BQU3 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdhaf3Q8BQU3 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdhaf3Q8BQU3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdhaf3Q8BQU3 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdhaf3Q8BQU3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdhaf3Q8BQU3 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdhaf3Q8BQU3 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdhaf3Q8BQU3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdhaf3Q8BQU3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdhaf3Q8BQU3 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdhaf3Q8BQU3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdhaf3Q8BQU3 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdhaf3Q8BQU3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdhaf3Q8BQU3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdhaf3Q8BQU3 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdhaf3Q8BQU3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdhaf3Q8BQU3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdhaf3Q8BQU3 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdhaf3Q8BQU3 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdhaf3Q8BQU3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdhaf3Q8BQU3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdhaf3Q8BQU3 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdhaf3Q8BQU3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdhaf3Q8BQU3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdhaf3Q8BQU3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdhaf3Q8BQU3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdhaf3Q8BQU3 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdhaf3Q8BQU3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdhaf3Q8BQU3 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdhaf3Q8BQU3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdhaf3Q8BQU3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdhaf3Q8BQU3 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdhaf3Q8BQU3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdhaf3Q8BQU3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdhaf3Q8BQU3 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdhaf3Q8BQU3 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdhaf3Q8BQU3 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdhaf3Q8BQU3 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdhaf3Q8BQU3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdhaf3Q8BQU3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdhaf3Q8BQU3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdhaf3Q8BQU3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdhaf3Q8BQU3 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdhaf3Q8BQU3 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdhaf3Q8BQU3 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdhaf3Q8BQU3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms