Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMK4

Ckap4, Cytoskeleton-associated protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap4Q8BMK4 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms