Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rufy1Q8BIJ7 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms