Protein–RNA interactions for Protein: Q8BII1

Prox2, Prospero homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox2Q8BII1 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prox2Q8BII1 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prox2Q8BII1 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Prox2Q8BII1 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prox2Q8BII1 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms