Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX3

Cdca8, Borealin, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca8Q8BHX3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cdca8Q8BHX3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cdca8Q8BHX3 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cdca8Q8BHX3 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cdca8Q8BHX3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cdca8Q8BHX3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cdca8Q8BHX3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cdca8Q8BHX3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdca8Q8BHX3 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdca8Q8BHX3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdca8Q8BHX3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdca8Q8BHX3 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdca8Q8BHX3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdca8Q8BHX3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdca8Q8BHX3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdca8Q8BHX3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdca8Q8BHX3 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdca8Q8BHX3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdca8Q8BHX3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdca8Q8BHX3 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdca8Q8BHX3 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdca8Q8BHX3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdca8Q8BHX3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdca8Q8BHX3 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdca8Q8BHX3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdca8Q8BHX3 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdca8Q8BHX3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdca8Q8BHX3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdca8Q8BHX3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdca8Q8BHX3 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdca8Q8BHX3 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdca8Q8BHX3 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdca8Q8BHX3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdca8Q8BHX3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cdca8Q8BHX3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cdca8Q8BHX3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cdca8Q8BHX3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cdca8Q8BHX3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cdca8Q8BHX3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cdca8Q8BHX3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cdca8Q8BHX3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cdca8Q8BHX3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cdca8Q8BHX3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Cdca8Q8BHX3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cdca8Q8BHX3 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cdca8Q8BHX3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cdca8Q8BHX3 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cdca8Q8BHX3 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cdca8Q8BHX3 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Cdca8Q8BHX3 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cdca8Q8BHX3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cdca8Q8BHX3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cdca8Q8BHX3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cdca8Q8BHX3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cdca8Q8BHX3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdca8Q8BHX3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdca8Q8BHX3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdca8Q8BHX3 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdca8Q8BHX3 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdca8Q8BHX3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdca8Q8BHX3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdca8Q8BHX3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdca8Q8BHX3 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdca8Q8BHX3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdca8Q8BHX3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdca8Q8BHX3 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdca8Q8BHX3 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdca8Q8BHX3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdca8Q8BHX3 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdca8Q8BHX3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdca8Q8BHX3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdca8Q8BHX3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdca8Q8BHX3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdca8Q8BHX3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdca8Q8BHX3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdca8Q8BHX3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdca8Q8BHX3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdca8Q8BHX3 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdca8Q8BHX3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdca8Q8BHX3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdca8Q8BHX3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdca8Q8BHX3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdca8Q8BHX3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdca8Q8BHX3 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdca8Q8BHX3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdca8Q8BHX3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdca8Q8BHX3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdca8Q8BHX3 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdca8Q8BHX3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdca8Q8BHX3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdca8Q8BHX3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdca8Q8BHX3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdca8Q8BHX3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdca8Q8BHX3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdca8Q8BHX3 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdca8Q8BHX3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdca8Q8BHX3 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdca8Q8BHX3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdca8Q8BHX3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdca8Q8BHX3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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