Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cyp4f39Q8BGU0 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms