Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGT7

Smndc1, Survival of motor neuron-related-splicing factor 30, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smndc1Q8BGT7 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smndc1Q8BGT7 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smndc1Q8BGT7 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smndc1Q8BGT7 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smndc1Q8BGT7 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smndc1Q8BGT7 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smndc1Q8BGT7 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smndc1Q8BGT7 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smndc1Q8BGT7 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smndc1Q8BGT7 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smndc1Q8BGT7 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smndc1Q8BGT7 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smndc1Q8BGT7 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smndc1Q8BGT7 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smndc1Q8BGT7 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smndc1Q8BGT7 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smndc1Q8BGT7 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smndc1Q8BGT7 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smndc1Q8BGT7 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Smndc1Q8BGT7 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smndc1Q8BGT7 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smndc1Q8BGT7 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smndc1Q8BGT7 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smndc1Q8BGT7 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smndc1Q8BGT7 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smndc1Q8BGT7 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smndc1Q8BGT7 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smndc1Q8BGT7 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smndc1Q8BGT7 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smndc1Q8BGT7 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smndc1Q8BGT7 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smndc1Q8BGT7 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smndc1Q8BGT7 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smndc1Q8BGT7 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smndc1Q8BGT7 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smndc1Q8BGT7 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smndc1Q8BGT7 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smndc1Q8BGT7 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smndc1Q8BGT7 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smndc1Q8BGT7 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smndc1Q8BGT7 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smndc1Q8BGT7 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smndc1Q8BGT7 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smndc1Q8BGT7 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smndc1Q8BGT7 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smndc1Q8BGT7 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smndc1Q8BGT7 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smndc1Q8BGT7 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smndc1Q8BGT7 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Smndc1Q8BGT7 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smndc1Q8BGT7 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Smndc1Q8BGT7 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smndc1Q8BGT7 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smndc1Q8BGT7 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smndc1Q8BGT7 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smndc1Q8BGT7 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smndc1Q8BGT7 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smndc1Q8BGT7 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smndc1Q8BGT7 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smndc1Q8BGT7 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Smndc1Q8BGT7 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smndc1Q8BGT7 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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