Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC1

UPF0489 protein C5orf22 homolog, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGC1 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Q8BGC1 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q8BGC1 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q8BGC1 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q8BGC1 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q8BGC1 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q8BGC1 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q8BGC1 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q8BGC1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q8BGC1 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q8BGC1 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q8BGC1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q8BGC1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q8BGC1 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q8BGC1 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q8BGC1 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q8BGC1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q8BGC1 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q8BGC1 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q8BGC1 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q8BGC1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Q8BGC1 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q8BGC1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q8BGC1 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q8BGC1 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q8BGC1 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q8BGC1 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q8BGC1 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q8BGC1 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q8BGC1 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q8BGC1 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q8BGC1 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q8BGC1 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q8BGC1 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q8BGC1 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q8BGC1 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q8BGC1 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q8BGC1 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q8BGC1 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q8BGC1 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q8BGC1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q8BGC1 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q8BGC1 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q8BGC1 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q8BGC1 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8BGC1 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8BGC1 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8BGC1 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8BGC1 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8BGC1 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8BGC1 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8BGC1 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8BGC1 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8BGC1 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8BGC1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8BGC1 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8BGC1 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8BGC1 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8BGC1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8BGC1 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8BGC1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8BGC1 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8BGC1 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8BGC1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8BGC1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8BGC1 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8BGC1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Q8BGC1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8BGC1 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8BGC1 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8BGC1 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q8BGC1 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Q8BGC1 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q8BGC1 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q8BGC1 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q8BGC1 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q8BGC1 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q8BGC1 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Q8BGC1 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q8BGC1 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q8BGC1 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q8BGC1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Q8BGC1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q8BGC1 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q8BGC1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q8BGC1 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q8BGC1 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Q8BGC1 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q8BGC1 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q8BGC1 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q8BGC1 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q8BGC1 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q8BGC1 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q8BGC1 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q8BGC1 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q8BGC1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q8BGC1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q8BGC1 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q8BGC1 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
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