Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG99

Pknox2, Homeobox protein PKNOX2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pknox2Q8BG99 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pknox2Q8BG99 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pknox2Q8BG99 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pknox2Q8BG99 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pknox2Q8BG99 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pknox2Q8BG99 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pknox2Q8BG99 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pknox2Q8BG99 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pknox2Q8BG99 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pknox2Q8BG99 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pknox2Q8BG99 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pknox2Q8BG99 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pknox2Q8BG99 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pknox2Q8BG99 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pknox2Q8BG99 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pknox2Q8BG99 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pknox2Q8BG99 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pknox2Q8BG99 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pknox2Q8BG99 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pknox2Q8BG99 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pknox2Q8BG99 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pknox2Q8BG99 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pknox2Q8BG99 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pknox2Q8BG99 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pknox2Q8BG99 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pknox2Q8BG99 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pknox2Q8BG99 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pknox2Q8BG99 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pknox2Q8BG99 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pknox2Q8BG99 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pknox2Q8BG99 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pknox2Q8BG99 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pknox2Q8BG99 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pknox2Q8BG99 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pknox2Q8BG99 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Pknox2Q8BG99 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pknox2Q8BG99 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pknox2Q8BG99 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pknox2Q8BG99 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pknox2Q8BG99 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pknox2Q8BG99 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pknox2Q8BG99 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pknox2Q8BG99 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pknox2Q8BG99 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pknox2Q8BG99 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pknox2Q8BG99 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pknox2Q8BG99 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pknox2Q8BG99 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pknox2Q8BG99 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pknox2Q8BG99 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pknox2Q8BG99 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pknox2Q8BG99 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pknox2Q8BG99 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pknox2Q8BG99 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pknox2Q8BG99 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pknox2Q8BG99 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pknox2Q8BG99 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pknox2Q8BG99 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pknox2Q8BG99 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pknox2Q8BG99 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pknox2Q8BG99 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pknox2Q8BG99 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pknox2Q8BG99 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pknox2Q8BG99 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pknox2Q8BG99 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pknox2Q8BG99 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pknox2Q8BG99 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pknox2Q8BG99 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pknox2Q8BG99 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pknox2Q8BG99 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pknox2Q8BG99 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pknox2Q8BG99 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pknox2Q8BG99 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pknox2Q8BG99 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pknox2Q8BG99 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pknox2Q8BG99 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pknox2Q8BG99 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pknox2Q8BG99 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pknox2Q8BG99 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pknox2Q8BG99 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pknox2Q8BG99 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pknox2Q8BG99 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Pknox2Q8BG99 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Pknox2Q8BG99 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Pknox2Q8BG99 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pknox2Q8BG99 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pknox2Q8BG99 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pknox2Q8BG99 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Pknox2Q8BG99 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pknox2Q8BG99 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pknox2Q8BG99 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pknox2Q8BG99 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pknox2Q8BG99 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pknox2Q8BG99 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pknox2Q8BG99 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pknox2Q8BG99 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pknox2Q8BG99 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pknox2Q8BG99 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pknox2Q8BG99 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pknox2Q8BG99 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms