Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG18

Necab1, N-terminal EF-hand calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necab1Q8BG18 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Necab1Q8BG18 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Necab1Q8BG18 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Necab1Q8BG18 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Necab1Q8BG18 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Necab1Q8BG18 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Necab1Q8BG18 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Necab1Q8BG18 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Necab1Q8BG18 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Necab1Q8BG18 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Necab1Q8BG18 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Necab1Q8BG18 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Necab1Q8BG18 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Necab1Q8BG18 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Necab1Q8BG18 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Necab1Q8BG18 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Necab1Q8BG18 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Necab1Q8BG18 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Necab1Q8BG18 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Necab1Q8BG18 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Necab1Q8BG18 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Necab1Q8BG18 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Necab1Q8BG18 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Necab1Q8BG18 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Necab1Q8BG18 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Necab1Q8BG18 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Necab1Q8BG18 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Necab1Q8BG18 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Necab1Q8BG18 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Necab1Q8BG18 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Necab1Q8BG18 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Necab1Q8BG18 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Necab1Q8BG18 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Necab1Q8BG18 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Necab1Q8BG18 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Necab1Q8BG18 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Necab1Q8BG18 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Necab1Q8BG18 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Necab1Q8BG18 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Necab1Q8BG18 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Necab1Q8BG18 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Necab1Q8BG18 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Necab1Q8BG18 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Necab1Q8BG18 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Necab1Q8BG18 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Necab1Q8BG18 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Necab1Q8BG18 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Necab1Q8BG18 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Necab1Q8BG18 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Necab1Q8BG18 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Necab1Q8BG18 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Necab1Q8BG18 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Necab1Q8BG18 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Necab1Q8BG18 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Necab1Q8BG18 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Necab1Q8BG18 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Necab1Q8BG18 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Necab1Q8BG18 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Necab1Q8BG18 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Necab1Q8BG18 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Necab1Q8BG18 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Necab1Q8BG18 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Necab1Q8BG18 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Necab1Q8BG18 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Necab1Q8BG18 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Necab1Q8BG18 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Necab1Q8BG18 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Necab1Q8BG18 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Necab1Q8BG18 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Necab1Q8BG18 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Necab1Q8BG18 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Necab1Q8BG18 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Necab1Q8BG18 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Necab1Q8BG18 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Necab1Q8BG18 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Necab1Q8BG18 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Necab1Q8BG18 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Necab1Q8BG18 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Necab1Q8BG18 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Necab1Q8BG18 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Necab1Q8BG18 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Necab1Q8BG18 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Necab1Q8BG18 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Necab1Q8BG18 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Necab1Q8BG18 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Necab1Q8BG18 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Necab1Q8BG18 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Necab1Q8BG18 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Necab1Q8BG18 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Necab1Q8BG18 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Necab1Q8BG18 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Necab1Q8BG18 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Necab1Q8BG18 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Necab1Q8BG18 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Necab1Q8BG18 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Necab1Q8BG18 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Necab1Q8BG18 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Necab1Q8BG18 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms