Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc172Q810N9 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc172Q810N9 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc172Q810N9 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc172Q810N9 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc172Q810N9 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc172Q810N9 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc172Q810N9 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc172Q810N9 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc172Q810N9 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc172Q810N9 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc172Q810N9 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc172Q810N9 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc172Q810N9 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc172Q810N9 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc172Q810N9 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc172Q810N9 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc172Q810N9 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc172Q810N9 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc172Q810N9 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc172Q810N9 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc172Q810N9 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc172Q810N9 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc172Q810N9 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc172Q810N9 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc172Q810N9 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc172Q810N9 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc172Q810N9 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc172Q810N9 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc172Q810N9 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc172Q810N9 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc172Q810N9 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc172Q810N9 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc172Q810N9 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc172Q810N9 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc172Q810N9 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc172Q810N9 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc172Q810N9 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc172Q810N9 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc172Q810N9 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc172Q810N9 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc172Q810N9 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc172Q810N9 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc172Q810N9 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc172Q810N9 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc172Q810N9 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc172Q810N9 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc172Q810N9 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc172Q810N9 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc172Q810N9 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc172Q810N9 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc172Q810N9 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc172Q810N9 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc172Q810N9 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc172Q810N9 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc172Q810N9 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc172Q810N9 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc172Q810N9 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc172Q810N9 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc172Q810N9 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc172Q810N9 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc172Q810N9 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc172Q810N9 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc172Q810N9 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc172Q810N9 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc172Q810N9 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc172Q810N9 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc172Q810N9 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc172Q810N9 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc172Q810N9 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccdc172Q810N9 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccdc172Q810N9 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccdc172Q810N9 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms