Protein–RNA interactions for Protein: Q810N8

Rhox11, Reproductive homeobox 11, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox11Q810N8 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhox11Q810N8 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhox11Q810N8 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhox11Q810N8 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhox11Q810N8 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhox11Q810N8 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rhox11Q810N8 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rhox11Q810N8 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rhox11Q810N8 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rhox11Q810N8 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rhox11Q810N8 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox11Q810N8 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox11Q810N8 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox11Q810N8 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox11Q810N8 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox11Q810N8 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox11Q810N8 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox11Q810N8 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox11Q810N8 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox11Q810N8 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox11Q810N8 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox11Q810N8 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox11Q810N8 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox11Q810N8 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox11Q810N8 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox11Q810N8 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox11Q810N8 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox11Q810N8 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox11Q810N8 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox11Q810N8 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox11Q810N8 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox11Q810N8 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox11Q810N8 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox11Q810N8 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox11Q810N8 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox11Q810N8 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox11Q810N8 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox11Q810N8 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox11Q810N8 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox11Q810N8 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox11Q810N8 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox11Q810N8 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox11Q810N8 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox11Q810N8 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox11Q810N8 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox11Q810N8 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox11Q810N8 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox11Q810N8 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox11Q810N8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox11Q810N8 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox11Q810N8 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox11Q810N8 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox11Q810N8 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox11Q810N8 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox11Q810N8 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox11Q810N8 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox11Q810N8 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox11Q810N8 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox11Q810N8 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox11Q810N8 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox11Q810N8 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox11Q810N8 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox11Q810N8 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox11Q810N8 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox11Q810N8 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox11Q810N8 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox11Q810N8 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox11Q810N8 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox11Q810N8 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox11Q810N8 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox11Q810N8 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox11Q810N8 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox11Q810N8 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox11Q810N8 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox11Q810N8 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox11Q810N8 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox11Q810N8 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox11Q810N8 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox11Q810N8 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox11Q810N8 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox11Q810N8 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox11Q810N8 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox11Q810N8 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox11Q810N8 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox11Q810N8 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox11Q810N8 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox11Q810N8 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox11Q810N8 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox11Q810N8 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox11Q810N8 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox11Q810N8 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox11Q810N8 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox11Q810N8 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox11Q810N8 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox11Q810N8 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox11Q810N8 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox11Q810N8 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox11Q810N8 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox11Q810N8 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox11Q810N8 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms