Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZS5

Cldn34b3, Claudin 34B3, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b3Q80ZS5 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms