Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ttc29Q80VM3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Ttc29Q80VM3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Ttc29Q80VM3 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Ttc29Q80VM3 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc29Q80VM3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc29Q80VM3 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc29Q80VM3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc29Q80VM3 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc29Q80VM3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc29Q80VM3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc29Q80VM3 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc29Q80VM3 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc29Q80VM3 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc29Q80VM3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc29Q80VM3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc29Q80VM3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc29Q80VM3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms