Protein–RNA interactions for Protein: Q80UK0

Sestd1, SEC14 domain and spectrin repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sestd1Q80UK0 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sestd1Q80UK0 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sestd1Q80UK0 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sestd1Q80UK0 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sestd1Q80UK0 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sestd1Q80UK0 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sestd1Q80UK0 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms