Protein–RNA interactions for Protein: Q80U57

Rims3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims3Q80U57 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rims3Q80U57 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rims3Q80U57 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms