Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
NischQ80TM9 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
NischQ80TM9 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
NischQ80TM9 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
NischQ80TM9 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
NischQ80TM9 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
NischQ80TM9 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
NischQ80TM9 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
NischQ80TM9 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
NischQ80TM9 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
NischQ80TM9 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
NischQ80TM9 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
NischQ80TM9 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
NischQ80TM9 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
NischQ80TM9 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
NischQ80TM9 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
NischQ80TM9 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
NischQ80TM9 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
NischQ80TM9 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
NischQ80TM9 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
NischQ80TM9 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
NischQ80TM9 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
NischQ80TM9 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
NischQ80TM9 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
NischQ80TM9 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
NischQ80TM9 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
NischQ80TM9 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
NischQ80TM9 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
NischQ80TM9 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
NischQ80TM9 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
NischQ80TM9 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
NischQ80TM9 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
NischQ80TM9 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
NischQ80TM9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
NischQ80TM9 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
NischQ80TM9 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
NischQ80TM9 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
NischQ80TM9 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
NischQ80TM9 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
NischQ80TM9 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
NischQ80TM9 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
NischQ80TM9 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
NischQ80TM9 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
NischQ80TM9 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
NischQ80TM9 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
NischQ80TM9 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
NischQ80TM9 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
NischQ80TM9 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
NischQ80TM9 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
NischQ80TM9 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
NischQ80TM9 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
NischQ80TM9 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
NischQ80TM9 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
NischQ80TM9 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
NischQ80TM9 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
NischQ80TM9 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
NischQ80TM9 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
NischQ80TM9 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC34.03■■■■□ 3.04
NischQ80TM9 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC34.03■■■■□ 3.04
NischQ80TM9 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
NischQ80TM9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
NischQ80TM9 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
NischQ80TM9 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
NischQ80TM9 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
NischQ80TM9 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
NischQ80TM9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
NischQ80TM9 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
NischQ80TM9 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
NischQ80TM9 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
NischQ80TM9 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC34.01■■■■□ 3.04
NischQ80TM9 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
NischQ80TM9 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
NischQ80TM9 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
NischQ80TM9 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
NischQ80TM9 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
NischQ80TM9 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
NischQ80TM9 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
NischQ80TM9 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
NischQ80TM9 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
NischQ80TM9 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
NischQ80TM9 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
NischQ80TM9 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
NischQ80TM9 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
NischQ80TM9 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
NischQ80TM9 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
NischQ80TM9 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
NischQ80TM9 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
NischQ80TM9 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
NischQ80TM9 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
NischQ80TM9 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
NischQ80TM9 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
NischQ80TM9 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC34■■■■□ 3.03
NischQ80TM9 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC34■■■■□ 3.03
NischQ80TM9 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC34■■■■□ 3.03
NischQ80TM9 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
NischQ80TM9 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
NischQ80TM9 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
NischQ80TM9 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
NischQ80TM9 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
NischQ80TM9 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
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