Protein–RNA interactions for Protein: Q80TJ7

Phf8, Histone lysine demethylase PHF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf8Q80TJ7 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phf8Q80TJ7 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phf8Q80TJ7 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Phf8Q80TJ7 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phf8Q80TJ7 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phf8Q80TJ7 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phf8Q80TJ7 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phf8Q80TJ7 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phf8Q80TJ7 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phf8Q80TJ7 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phf8Q80TJ7 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phf8Q80TJ7 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phf8Q80TJ7 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phf8Q80TJ7 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Phf8Q80TJ7 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf8Q80TJ7 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf8Q80TJ7 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf8Q80TJ7 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf8Q80TJ7 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf8Q80TJ7 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf8Q80TJ7 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf8Q80TJ7 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf8Q80TJ7 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf8Q80TJ7 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf8Q80TJ7 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf8Q80TJ7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf8Q80TJ7 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf8Q80TJ7 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf8Q80TJ7 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf8Q80TJ7 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf8Q80TJ7 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf8Q80TJ7 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf8Q80TJ7 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf8Q80TJ7 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf8Q80TJ7 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf8Q80TJ7 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf8Q80TJ7 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf8Q80TJ7 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf8Q80TJ7 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phf8Q80TJ7 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phf8Q80TJ7 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phf8Q80TJ7 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phf8Q80TJ7 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phf8Q80TJ7 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phf8Q80TJ7 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phf8Q80TJ7 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phf8Q80TJ7 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phf8Q80TJ7 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phf8Q80TJ7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phf8Q80TJ7 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phf8Q80TJ7 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phf8Q80TJ7 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phf8Q80TJ7 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phf8Q80TJ7 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phf8Q80TJ7 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phf8Q80TJ7 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phf8Q80TJ7 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phf8Q80TJ7 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phf8Q80TJ7 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phf8Q80TJ7 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phf8Q80TJ7 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Phf8Q80TJ7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms