Protein–RNA interactions for Protein: Q7TST5

Lamp3, Lysosome-associated membrane glycoprotein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp3Q7TST5 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lamp3Q7TST5 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lamp3Q7TST5 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lamp3Q7TST5 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lamp3Q7TST5 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lamp3Q7TST5 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lamp3Q7TST5 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lamp3Q7TST5 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lamp3Q7TST5 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lamp3Q7TST5 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lamp3Q7TST5 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lamp3Q7TST5 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lamp3Q7TST5 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Lamp3Q7TST5 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lamp3Q7TST5 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lamp3Q7TST5 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lamp3Q7TST5 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lamp3Q7TST5 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lamp3Q7TST5 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lamp3Q7TST5 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lamp3Q7TST5 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lamp3Q7TST5 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lamp3Q7TST5 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lamp3Q7TST5 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lamp3Q7TST5 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lamp3Q7TST5 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Lamp3Q7TST5 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Lamp3Q7TST5 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lamp3Q7TST5 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lamp3Q7TST5 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lamp3Q7TST5 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lamp3Q7TST5 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lamp3Q7TST5 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lamp3Q7TST5 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lamp3Q7TST5 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lamp3Q7TST5 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lamp3Q7TST5 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lamp3Q7TST5 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lamp3Q7TST5 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lamp3Q7TST5 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lamp3Q7TST5 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lamp3Q7TST5 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lamp3Q7TST5 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lamp3Q7TST5 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lamp3Q7TST5 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lamp3Q7TST5 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lamp3Q7TST5 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lamp3Q7TST5 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lamp3Q7TST5 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lamp3Q7TST5 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lamp3Q7TST5 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lamp3Q7TST5 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lamp3Q7TST5 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lamp3Q7TST5 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lamp3Q7TST5 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lamp3Q7TST5 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lamp3Q7TST5 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lamp3Q7TST5 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lamp3Q7TST5 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lamp3Q7TST5 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Lamp3Q7TST5 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lamp3Q7TST5 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Lamp3Q7TST5 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lamp3Q7TST5 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lamp3Q7TST5 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lamp3Q7TST5 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lamp3Q7TST5 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lamp3Q7TST5 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lamp3Q7TST5 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lamp3Q7TST5 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lamp3Q7TST5 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lamp3Q7TST5 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Lamp3Q7TST5 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lamp3Q7TST5 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lamp3Q7TST5 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lamp3Q7TST5 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lamp3Q7TST5 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lamp3Q7TST5 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lamp3Q7TST5 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lamp3Q7TST5 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lamp3Q7TST5 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lamp3Q7TST5 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Lamp3Q7TST5 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Lamp3Q7TST5 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Lamp3Q7TST5 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lamp3Q7TST5 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lamp3Q7TST5 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lamp3Q7TST5 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lamp3Q7TST5 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lamp3Q7TST5 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lamp3Q7TST5 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lamp3Q7TST5 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lamp3Q7TST5 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lamp3Q7TST5 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lamp3Q7TST5 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lamp3Q7TST5 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lamp3Q7TST5 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lamp3Q7TST5 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lamp3Q7TST5 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lamp3Q7TST5 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms